@inproceedings{minard-etal-2020-deft,
title = "{DOING}@{DEFT} : cascade de {CRF} pour l{'}annotation d{'}entit{\'e}s cliniques imbriqu{\'e}es ({DOING}@{DEFT} : cascade of {CRF} for the annotation of nested clinical entities)",
author = "Minard, Anne-Lyse and
Roques, Andr{\'e}ane and
Hiot, Nicolas and
Halfeld Ferrari Alves, Mirian and
Savary, Agata",
editor = "Cardon, R{\'e}mi and
Grabar, Natalia and
Grouin, Cyril and
Hamon, Thierry",
booktitle = "Actes de la 6e conf{\'e}rence conjointe Journ{\'e}es d'{\'E}tudes sur la Parole (JEP, 33e {\'e}dition), Traitement Automatique des Langues Naturelles (TALN, 27e {\'e}dition), Rencontre des {\'E}tudiants Chercheurs en Informatique pour le Traitement Automatique des Langues (R{\'E}CITAL, 22e {\'e}dition). Atelier D{\'E}fi Fouille de Textes",
month = "6",
year = "2020",
address = "Nancy, France",
publisher = "ATALA et AFCP",
url = "https://aclanthology.org/2020.jeptalnrecital-deft.7",
pages = "66--78",
abstract = "Cet article pr{\'e}sente le syst{\`e}me d{\'e}velopp{\'e} par l{'}{\'e}quipe DOING pour la campagne d{'}{\'e}valuation DEFT 2020 portant sur la similarit{\'e} s{\'e}mantique et l{'}extraction d{'}information fine. L{'}{\'e}quipe a particip{\'e} uniquement {\`a} la t{\^a}che 3 : {``}extraction d{'}information{''}. Nous avons utilis{\'e} une cascade de CRF pour annoter les diff{\'e}rentes informations {\`a} rep{\'e}rer. Nous nous sommes concentr{\'e}s sur la question de l{'}imbrication des entit{\'e}s et de la pertinence d{'}un type d{'}entit{\'e} pour apprendre {\`a} reconna{\^\i}tre un autre. Nous avons {\'e}galement test{\'e} l{'}utilisation d{'}une ressource externe, MedDRA, pour am{\'e}liorer les performances du syst{\`e}me et d{'}un pipeline plus complexe mais ne g{\'e}rant pas l{'}imbrication des entit{\'e}s. Nous avons soumis 3 runs et nous obtenons en moyenne sur toutes les classes des F-mesures de 0,64, 0,65 et 0,61.",
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<title>DOING@DEFT : cascade de CRF pour l’annotation d’entités cliniques imbriquées (DOING@DEFT : cascade of CRF for the annotation of nested clinical entities)</title>
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<title>Actes de la 6e conférence conjointe Journées d’Études sur la Parole (JEP, 33e édition), Traitement Automatique des Langues Naturelles (TALN, 27e édition), Rencontre des Étudiants Chercheurs en Informatique pour le Traitement Automatique des Langues (RÉCITAL, 22e édition). Atelier DÉfi Fouille de Textes</title>
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<abstract>Cet article présente le système développé par l’équipe DOING pour la campagne d’évaluation DEFT 2020 portant sur la similarité sémantique et l’extraction d’information fine. L’équipe a participé uniquement à la tâche 3 : “extraction d’information”. Nous avons utilisé une cascade de CRF pour annoter les différentes informations à repérer. Nous nous sommes concentrés sur la question de l’imbrication des entités et de la pertinence d’un type d’entité pour apprendre à reconnaître un autre. Nous avons également testé l’utilisation d’une ressource externe, MedDRA, pour améliorer les performances du système et d’un pipeline plus complexe mais ne gérant pas l’imbrication des entités. Nous avons soumis 3 runs et nous obtenons en moyenne sur toutes les classes des F-mesures de 0,64, 0,65 et 0,61.</abstract>
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%X Cet article présente le système développé par l’équipe DOING pour la campagne d’évaluation DEFT 2020 portant sur la similarité sémantique et l’extraction d’information fine. L’équipe a participé uniquement à la tâche 3 : “extraction d’information”. Nous avons utilisé une cascade de CRF pour annoter les différentes informations à repérer. Nous nous sommes concentrés sur la question de l’imbrication des entités et de la pertinence d’un type d’entité pour apprendre à reconnaître un autre. Nous avons également testé l’utilisation d’une ressource externe, MedDRA, pour améliorer les performances du système et d’un pipeline plus complexe mais ne gérant pas l’imbrication des entités. Nous avons soumis 3 runs et nous obtenons en moyenne sur toutes les classes des F-mesures de 0,64, 0,65 et 0,61.
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[DOING@DEFT : cascade de CRF pour l’annotation d’entités cliniques imbriquées (DOING@DEFT : cascade of CRF for the annotation of nested clinical entities)](https://aclanthology.org/2020.jeptalnrecital-deft.7) (Minard et al., JEP/TALN/RECITAL 2020)
ACL
- Anne-Lyse Minard, Andréane Roques, Nicolas Hiot, Mirian Halfeld Ferrari Alves, and Agata Savary. 2020. DOING@DEFT : cascade de CRF pour l’annotation d’entités cliniques imbriquées (DOING@DEFT : cascade of CRF for the annotation of nested clinical entities). In Actes de la 6e conférence conjointe Journées d'Études sur la Parole (JEP, 33e édition), Traitement Automatique des Langues Naturelles (TALN, 27e édition), Rencontre des Étudiants Chercheurs en Informatique pour le Traitement Automatique des Langues (RÉCITAL, 22e édition). Atelier DÉfi Fouille de Textes, pages 66–78, Nancy, France. ATALA et AFCP.